Nomenclature EC / Classification EC

La nomenclature EC (EC est le sigle de Enzyme Commission numbers, la Commission des enzymes) est une classification numérique des enzymes, basée sur la réaction chimique qu'elles catalysent. Comme dispositif de nomenclature des enzymes, chaque numéro EC est associé à un nom recommandé pour l'enzyme correspondante.

Chaque code d'enzyme consiste en les lettres majuscules «EC» suivies de quatre nombres scindés par des points. Ces nombres représentent chacun une étape dans la précision de la classification de l'enzyme. A titre d'exemple, l'enzyme tripeptide aminopeptidase a le code EC 3.4.11.4 qui est construit comme suit : 3 veut dire une hydrolase (enzymes qui utilisent l'eau pour détruire une autre molécule), 3.4 veut dire hydrolases agissant sur des liens peptidiques, 3.4.11 implique celles qui détachent un acide aminé amino-terminal d'un polypeptide et 3.4.11.4 implique celles qui détachent cet acide aminé amino-terminal d'un tripeptide.

Les quatre nombres de la nomenclature EC des enzymes désignent chacun une caractéristique de l'enzyme qui sert à l'identifier. Le premier nombre de la nomenclature EC indique le type de réaction catalysée, le second le substrat général impliqué lors de la réaction, le troisième le substrat spécifique impliqué et le quatrième le numéro de série de l'enzyme.

Le niveau supérieur de cette classification est

• EC 1 Oxydoréductases : catalysent les réactions d'oxydo-réduction
• EC 2 Transférases : transfèrent un groupement fonctionnel (par exemple un groupe méthyle ou phosphate)
• EC 3 Hydrolases : catalysent l'hydrolyse de diverses liaisons
• EC 4 Lyases : brisent diverses liaisons par d'autres procédés que l'hydrolyse et l'oxydation
• EC 5 Isomérases : catalysent les réactions d'isomérisation dans une simple molécule
• EC 6 Ligases : joignent deux molécules par des liaisons covalentes

La nomenclature complète peut être vue à l'adresse http ://www. chem. qmul. ac. uk/iubmb/enzyme/

Au sens strict du terme, la nomenclature EC ne spécifie pas d'enzymes, mais des réactions catalysées par des enzymes. Des enzymes provenant de différents organismes et catalysant la même réaction reçoivent le même code EC. Pour identifier de manière unique une protéine par sa séquence d'acides aminés, on peut utiliser les identifiants Swiss-Prot et la base ENZYME (http ://www. expasy. org/enzyme) qui regroupe codes EC, identifiants Swiss-Prot, liens vers d'autres base et références bibliographiques.

La nomenclature des enzymes a été développée dès 1955, quand le Congrès Mondial de Biochimie à Bruxelles a créé l'Enzyme Commission (Commission des Enzymes). La première version fut publiée en 1961. La version actuelle est la sixième, et a été publiée par l'Union mondiale de biochimie et de biologie moléculaire (IUBMB) en 1992 et contient 3 196 enzymes différentes.

Voir aussi

• Nomenclature TC (classification des protéines de transport membranaire)
• BRENDA

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